Zootekni Bölümü, akademik ve idari yönetimde etkin, şeffaf ve hesap verebilir bir yönetişim modeli benimsemektedir. Yönetişim yapısında, akademik personelin yanı sıra öğrencilerin ve dış paydaşların da katılımını teşvik eden mekanizmalar geliştirilmektedir. Bölüm, fakülte bünyesindeki diğer bölümlerle iş birliği içinde çalışarak eğitim-öğretim, araştırma ve toplumsal katkı faaliyetlerini bütüncül bir yaklaşımla sürdürmektedir. Bölüm başkanı, kalite yönetimi süreçlerinin yürütülmesinde önemli bir rol üstlenmekte olup, aynı zamanda Anabilim Dalı Başkanlığı görevini de yürütmektedir. Akademik kurul, kalite komisyonları ve öğrenci temsilcileri gibi mekanizmalar, bölümün karar alma süreçlerinde aktif rol oynamaktadır.