Arkeoloji Bölümü, Fen Edebiyat Fakültesi’nin belirlediği kalite, yönetişim ve liderlik ilkeleri doğrultusunda yönetilmektedir. Bölümümüz, fakültenin genel idari yapısı içinde Dekan, Dekan Yardımcıları, fakülte kurulu, fakülte yönetim kurulu, fakülte sekreteri ve bölüm başkanları gibi yönetsel organlarla faaliyetlerini sürdürmekte, akademik ve idari süreçlerini üst yönetimin rehberliğinde yürütmektedir. Fakültemizdeki yönetişim modeli ve idari yapının oluşumunda; karar verme mekanizmaları, kurulların çok sesliliği ve bağımsız hareket kabiliyeti, paydaşların temsil edilmesi, modelin kurumsallığı ve sürekliliği yerleşmiş ve benimsenmiştir.
Bölüm başkanlığı, Arkeoloji Bölümü’nün en üst düzey idari organı olup, bölümde gerçekleştirilen tüm akademik ve yönetsel faaliyetlerin koordinasyonundan sorumludur. Ayrıca, bölümün etkin şekilde işleyişini sağlamak amacıyla çeşitli koordinatörlükler, komisyonlar, danışmanlık birimleri ve öğrenci temsilcilikleri gibi destekleyici yönetim mekanizmaları oluşturulmaktadır. Bu yapılar, bölümün akademik, idari ve sosyal süreçlerinde şeffaflığı ve sürdürülebilirliği sağlayarak, paydaşların görüş ve önerilerinin ilgili birimlere iletilmesine katkıda bulunmaktadır.